Kesiswaan SMAIT NFBS Bogor merupakan bagian yang tidak terpisahkan dalam mengembangkan minat santri NFBS pada kegiatan yang berkaitan dengan kepemimpinan dan karir santri pasca SMA

Kesiswaan NFBS memiliki fokus kegiatan sebagai berikut :

1. Kegiatan Ekstrakurikuler

SMAIT NFBS Bogor memiliki beberapa kegiatan ekstrakurikuler yang dapat dipilih oleh santri sejak mereka masuk di jenjang kelas 10. Adapun kegiatan ekskul di SMAIT NFBS Bogor adalah sbb :

1. Pramuka
2. Pencak Silat: Tapak Suci
3. Taekwondo
4. Basket
5. Cooking
6. Badminton
7. Olympiad Science Club (Matematika, Fisika, Kimia, Biologi, Geografi, Ekonomi)
8. English
9. Futsal
10. Bola Voli
11. Coding
12. Bahasa Asing (Jepang, Perancis, Arab)
2. Leadership

Dalam kegiatan Leadership, Kesiswaan SMAIT memberikan pembelajaran kepemimpinan secara berjenjang yang di sebut Leadership School (LS). LS dilakukan sebanyak 4 tahap yang wajib diikuti oleh seluruh santri kelas 10/11. Setiap tahap dalam LS memiliki target capaian yang berbeda-beda disetiap tahapannya.

1. LS 1 (matriks) diwajibkan bagi kelas 10. Dalam kegiatan ini santri diarahkan untuk menyadari potensi dirinya
2. LS 2, diwajibkan bagi santri kelas 10. Pada aktivitas LS 2, santri diarahkan untuk menyadari perannya sebagai hamba Allah, seorang anak, dan seorang santri. Diharapkan setelah LS 2 ini santri mendapatkan pencerahan bahwa hidup memiliki peran yang perlu dijalankan
3. LS 3, diwajibkan bagi santri yang aktif dalam kepengurusan OS, calon pengurus OS, atau keinginan sendiri dan mendaftar pada panitia. LS3 melatih santri untuk membangkitkan rasa simpati dan empatinya, dan Setelah mengikuti kegiatan LS 3 diharapkan santri dapat membuat kegiatan bermanfaat bagi masyarakat sekitar
4. LS 4, diwajibkan bagi BPH pengurus OS yang diamanahkan dalam LS 4 ini membuat acara berskala nasional/internasional yang menghasilkan sebuah keputusan Bersama dan disampaikan hasilnya pada pihak terkait
3. Organisasi Santri

SMAIT NFBS Bogor saat ini memiliki 4 organisasi santri (OS) untuk menampung minat santri NFBS yang berbeda-beda. Jika menyukai kerja berpikir dan evaluator bisa menjadi anggota MPK. Jika ingin belajar bagaimana melayani masyarakat SMA pada tingkatan eksekutif bisa menjadi pengurus OSIS atau OS Sport. OS Sport merupakan OS yang bertanggung jawab dalam menjalankan kegiatan olahraga atau ekskul olahraga di tataran santri SMAIT NFBS Bogor. Dan jika santri menyukai kegiatan menyenangkan dalam kegiatan outdoor bisa menjadi pengurus Pramuka.

4. Tim Adab NFBS

Disediakan bagi santri yang ingin menebar manfaat pada sesame santri NFBS terutama dalam penegakan disiplin santri.

5. Career Development : Student Journey & Internship.

Dalam program ini santri akan dipandu agar dapat membuat sebuah rencana perjalanan, baik dalam negeri/luar negeri dengan tujuan yang disesuaikan dengan rencana studi pasca SMA, atau disesuaikan dengan impian karir di masa depan.