Selain dipandu oleh kurikulum nasional, NFBS Bogor mengembangkan kurikulum berbasis konstruktif, kurikulum dengan mengintegrasikan nilai islam (SMART), kurikulum berbasis pengalaman belajar, dan kurikulum ketrampilan berpikir tingkat tinggi (HOTS) untuk mempersiapkan siswa agar dapat menghadapi tantangan global di masa depan.Pendekatan computational thinking dengan strategi visible thinking routine dan penggunaan graphic organizer digunakan dalam mendukung budaya berpikir.
Selain kurikulum pembelajaran di sekolah, juga diperkuat oleh kurikulum yang mencerminkan kekhususan Nurul Fikri seperti tahfidzul Qur’an, pengembangan pribadi islam dan kajian kitab.